フィリピン軍によると、１９６８年に組織されたNPAは、これまでに３万人を殺害したとみられる。社会主義者を自称するドゥテルテ大統領の就任以来、NPAは政府との和平交渉を断続的に行っており、来月には正式な和平交渉を再開する予定になっていた。同島西部の中央部のラナオ湖北のマラウィ市（人口約２０万人）では、ＩＳ系のマウテグループがマラウィ市を占領、５月２３日ドウテルテは訪問先のロシアで戒厳令を発令し、急遽、帰国して対策にあった。１・２週間で平定できると豪語していたが、マウテグループに、アブ・サヤフ、ジェマ・イスラミアなどほかのＩＳ系武装組織や、外人部隊も合流し、政府軍と戦闘状態が続いている。
ＩＳ系武装組織は、多くの市民を盾にしており、政府軍は市の２／３を制圧したものの、それ以上進めずにいる。

この間、比政府は米軍特殊部隊の支援を要請、政府軍と米特殊部隊が共同して制圧に当たっているが、ＩＳ系側も海外からの流入により、戦闘は拡大している。
また、過去、武装勢力として最大の組織だったモロ・イスラム解放戦線（ＭＩＬＦ）は主流派が政府と和解したものの、反主流派は和解を拒絶して武装闘争を継続させている。

ドウテルテは、タバオ市長時代に、恩師が幹部になっていた共産党と和解し、その共産軍もタバオ市一帯の麻薬組織の壊滅作戦に自警団として参加していたといわれている。ただ、和解は地域限定版だったようだ。

ただ、こうした人脈から現在も政府と和解への動きもあるが、常に和解では、主流派と反主流派とに分裂する。
今回、大統領警護隊に攻撃を仕掛けた組織が、主流派か反主流派かは不明だが、内部抗争もあっているものと見られる。

また、武装闘争を辞めても、その組織員は社会になじめず、再び武装闘争に身を投じる者たちも多いという。
極端な貧富の格差
島間の格差・地位間格差
宗教対立：
比人口は約１億人、キリスト教徒が９割を占め、イスラム教徒は５％、そのほとんどがミンダナオ島に居住している。ミンダナオ島の人口は約２４００万人。
（ＩＳ系武装勢力は、イスラム教徒の多いマレーシア・インドネシア・フィリピン（ミンダナオ）の広域に、イスラム国を建設する計画を有し、連携している。）
政府軍との対立
麻薬販売
ジャングル潜伏
海賊行為
海外ＩＳ関連組織による軍事的支援
・・・エトセトラ