気象庁の発表によると、前線が九州から本州の南にのびており、前線に向かって暖かく湿った空気が流れ込んでいる。また、日本海には上空約５５００メートルに氷点下１２度以下の寒気を伴った気圧の谷があって、北日本に接近している。

こうした梅雨前線の影響で、九州や四国では２０日、局地的に雷を伴い大雨に見舞われた。
熊本地震で被害を受けた熊本県内でも強い雨が降り、午前９時現在、南阿蘇村の１８３２世帯４３７９人、西原村の４４５世帯１３１１人に避難指示、合志市など３市町村の約７５００人に避難勧告が出された。
　福岡管区気象台によると、午前１１時までの１時間雨量は、
佐賀県嬉野市５４・５ミリ、
大分市４８・５ミリ、
南阿蘇村４１・５ミリなど。
交通機関にも影響し、ＪＲ九州によると、福岡、佐賀両県を除く九州各県の在来線で運転見合わせや遅れが相次いだ。

一方、四国の高知県宿毛市では午前９時半までの１時間に３５ミリの激しい雨が降った。