エジプト軍は、３日深夜、首都カイロ市内に装甲車などを展開して大統領支持派を包囲したり、国営テレビを管理下に置いた。
その後、軍部のシシ国防相がテレビ演説、モルシ大統領が国民の要求に応じなかったと批判したうえで、憲法を一時停止して大統領選挙を早期に実施するとともに憲法裁判所の長官が暫定大統領に就任すると発表し、モルシ大統領を解任して事実上のクーデターに踏み切ったことを明らかにした。
これに対して、モルシ大統領は、大統領府のツイッターでクーデターを拒否し平和的に抵抗を続けるよう国民に呼びかけている。
大統領を支持するイスラム組織「ムスリム同胞団」は、モルシ大統領は、国防省の施設に移されたということで、大統領が具体的にどのような状況に置かれているかは分かっていない。

国営通信によると、治安当局は与党・自由公正党のカタトニ党首らムスリム同胞団の幹部を相次いで拘束するなど、大統領側の反発を力で抑え込むため強硬手段に出ているという。

モルシ大統領の支持者は、民主的に選ばれた大統領に対するクーデターは民主化に逆行するとして強く反発しており、各地で反大統領派や治安部隊と衝突している。
ロイター通信によると、北部の町、マルサマトルーフで８人が死亡したほか、アレクサンドリアでも３人が死亡するなど、これまでに合わせて１４人が死亡しており、事態が収拾に向かうのか予断を許さない情勢が続いている。

アメリカは、モルシ大統領が過去イスラエルを批判していたことから嫌っており、イスラエルとエジプトを中東の政策の柱とするアメリカが、裏でデモを先導・扇動し、懇意にしているエジプト軍を使い、頭の首を据え替えさせる動きに出たとも思われる。
オバマが、エジプト軍の介入に強い懸念を示しても、それはパフォーマンス。